Consiste en la administración de microorganismos -bacterias y levaduras- en las cantidades adecuadas, para ejercer una acción beneficiosa en la salud del paciente.  Podría pensarse que esta acción debería esperarse con la presencia de esos agentes vivos, pero no es así, porque se ha podido comprobar que la administración de esas especies liofilizadas produce un efecto significativamente mayor. Se puede decir que cada mucosa, tiene una población microbiana bien definida en variedad y número de especies concretas.